由于轉子的加工誤差和離心機安裝誤差造成轉子質心在不同程度上偏離離心機主軸，因此，在轉子開始旋轉時就會產生振動，這些振動在某些特定轉速下會與離心機驅動系統的固有頻率發生共振，從而會引起整個系統強烈振動。出現此類現象時的轉速被稱為臨界轉速，臨界轉速與離心機和與之所配用的轉子有相關性。一臺離心機可以配用數種不同離心容量的轉子，因此在設計離心機時應該考慮到離心機的減振設計對各種轉子的包容性。離心機的轉速范圍很寬，從幾千轉/分鐘至幾萬轉/分鐘，離心機振動發生的轉速越快， 其危險性就越大。
    人類在加工任何東西的時候肯定會出現誤差，加工精度越高，誤差就越小，但是加工的成本則大大地提高了。離心機設計時用多種知識的綜合利用來達到允許一定的加工誤差，使得離心機產生的振動控制在正常范圍之內。但是如果用戶在使用不當的情況下，就會破壞了這種設計的平衡，導致嚴重事故。
    一旦在高轉速的情況下發生振動，應立即以z快的速度使離心機停止工作，所有的人員應快速撤離現場，以免會發生斷軸等事故時造成人員的傷害。絕不能斷電，一斷電，剎車（快速降速）就沒有了，轉子停轉很慢。事故一般都是由于離心機得操作不當引起的，如轉子在主軸上沒安裝好、轉子的蓋子沒有*蓋好、甩開轉子的吊籃沒安放好等。這種事故的發生是伴隨著巨大聲音，300~400kg的離心機突然旋轉越過270度。打開蓋子可以看到轉子已經躺在腔內，取出轉子時可觀察到轉子的外緣面已經嚴重刮傷變色，離心腔的內壁也會遭到受損，甚至制冷劑泄露。有時轉子和轉子蓋都產生了分離，試管中的液體都灑在腔內，主軸出現斷開或嚴重彎曲現象。由于用戶的操作不當而引起的這種事故是屢屢發生的，現代的離心機一般都具有自動不平衡的保護功能。即離心機啟動時一旦轉子的振動大于一定得數值時，離心機就會發出報警并自動降速停機，具有這種性能的離心機有時也會出現漏報現象，所以不能*確保不出事故。